La Junta Directiva es el órgano de gobierno de la Asociación tal y como se recoge en los Estatutos (art. 29). Sus funciones principales son:
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Ejecutar y vigilar que se cumplan los acuerdos tomados por la Asamblea General.
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Inspeccionar la contabilidad y demás funciones administrativas.
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Designar a la Dirección general así como definir y delegar en ella las decisiones operativas, guardando para sí las decisiones relativas a la ejecución de políticas y estrategias de desarrollo de la Asociación.
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Dirimir cuantos asuntos o conflictos se planteen entre las personas asociadas y/o las organizaciones territoriales de la Asociación.